Voor Regulus (of andere biochemici)

[123]

Ik ben opzoek naar een 3D stuctuur (foto) van het enzyme hemopexine.
Wie kan me helpen?

[Rouwkema]

Re: Voor Regulus (of andere biochemici)

Ik ben opzoek naar een 3D stuctuur (foto) van het enzyme hemopexine.
Wie kan me helpen?

Gewoon even images googelen op hemopexin (of hemopexine)

[123]

Re: Voor Regulus (of andere biochemici)

Gewoon even images googelen op hemopexin (of hemopexine)

Ik heb het net gedaan.Het zijn de verkeerde structuren daar.
Ik ben iets vergeten bij te zeggen: aan de hemopexine zit een ATP-groep.
dit moet ook daar te zien zijn. dus wie helpt"?

Ik heb dit gevonden via ncbi :

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structur....cgi?uid=11085

[ThierryM]

Re: Voor Regulus (of andere biochemici)

Kijk eens hier, figuur 2.

Waarvoor heb je het nodig?

[123]

Re: Voor Regulus (of andere biochemici)

Het is voor een stageverslag, Flukee. Het ging mij meer om de
protease activiteit van Hemopexine. Het is bekend dat naar het vervoer van haemgroep hemopexine ook betrokken is bij vaatverwijding in zwangerschap.
Aan de hemepexine zit een ATP groep en als deze verwijdert wordt krijgt deze protease activiteit. Hempexine is dan in staat om angiothensine I receptor , AT-1 te knippen. waardoor angiothensine niet op AT-1 kan zitten en voor vaatvernauwing kan zorgen. etc etc.

Ik moet nu een figuur hebben die deze SITE aan kan geven.

[ThierryM]

Re: Voor Regulus (of andere biochemici)

Ik denk dat een kristalstructuur van die precieze site een beetje overkill is. In principe kun je zo'n structuur met een geschikt programma in 3D bekijken en dan vanuit verschillende standpunten screenshots maken. Maar zo'n zaken zijn eigenlijk vooral domein van gespecialiseerde labo's.

Je vindt ook vaak afbeeldingen die de aminozuursequentie weergeven, waarop binding sites, katalytisch domein e.d. ook opstaan. Ik zou eerder zoiets gebruiken als het toch maar illustratief is.

[Guest41]

Re: Voor Regulus (of andere biochemici)

:d .............

[123]

Re: Voor Regulus (of andere biochemici)

Ik denk dat een kristalstructuur van die precieze site een beetje overkill is. In principe kun je zo'n structuur met een geschikt programma in 3D bekijken en dan vanuit verschillende standpunten screenshots maken. Maar zo'n zaken zijn eigenlijk vooral domein van gespecialiseerde labo's.

Je vindt ook vaak afbeeldingen die de aminozuursequentie weergeven, waarop binding sites, katalytisch domein e.d. ook opstaan. Ik zou eerder zoiets gebruiken als het toch maar illustratief is.

Ik dacht dat het een enzyme was, waarvan de structuur makkelijk te vinden was.Ik ben het met je eens, ik denk dat ik het gewoon weglaat. Het was wel mooi geweest als ik het wel had.wat stel je zelf voor?

In mijn bioinformatica boek staat dit link: http://www.bioinf.manchester.ac.uk/dbbrowser/PRINTS/

Hier zou het mogelijk zijn om de ATP bindingplaats te vinden(met volgorde GSGKT). Het heet Walker A ATP-binding motif.

Mijn vraag: kan ik dit toepassen?

[123]

Re: Voor Regulus (of andere biochemici)

http://www.maths.gla.ac.uk/~rs/MathBio/hemopexin.gif ??
http://en.wikipedia.org/wiki/Haemopexin (tekening is te vergroten png file)

Er zijn veel publicaties te vinden over de 3D structuur .. helaas zijn die niet vrij te consulteren .. (enkel via de bibliotheek van uw studieinstelling, als ze er een abo voor hebben tenminste, en zelfs daar zijn er inter)bibliotheek afspraken ivm met een financieele tussenkomst ivm de verwerkingskosten zoals bvb het aanmaken van een pdf bestand)

Ik heb toegang tot alle publicaties van Pubmed.Je mag me de link wel sturen als het kan.

[Guest41]

Re: Voor Regulus (of andere biochemici)

....................

[123]

Re: Voor Regulus (of andere biochemici)

hmmm .. beetje vervelend want ik kan je geen links sturen omdat ik sinds 1/1/08 geen toegang meer heb tot een aantal "subscribed" locations (in ben op rust )
Je kan echter sneller zoeken als je via de google scholar link gaat http://scholar.google.be/schhp?sourceid=navclient&hl=en
HTH

Hi no problem, Ik zal wel wat daarop verzinnen
Ik zoek zelf wel verder op, bedankt